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发现糖尿病少年的基因秘密,WES技术助力线粒体疾病诊断
发布:2024/04/10


多饮、多尿、多食、消瘦,经典的“三多一少”,这是糖尿病患者的典型临床症状。近日,一位来自浙江衢州的12岁男孩走进了内分泌科诊室,主诉出现口干、多饮、易饥饿的症状,经医院检查,确诊为糖尿病。临床医生在追溯其家族史时发现,男孩的奶奶也患有糖尿病。为了更好地明确病因以及精准治疗,男孩接受了单基因糖尿病基因检测。


经基因检测,发现受检者线粒体基因MT-ND6上 m.14692A>G的均质性变异,ClinVar数据库收录该变异位点为致病[1]。线粒体基因突变糖尿病的典型临床特点为发病早、体型消瘦、胰岛B细胞功能逐新减退,常伴神经性耳聋或伴其他神经肌肉表现。




什么是线粒体


线粒体是细胞内最重要的细胞器之一,除了红细胞外,几乎所有细胞都存在线粒体。它是各种细胞代谢途径中间代谢的重要整合者,包括脂肪酸氧化、氧化磷酸化、尿素循环、糖异生、TCA循环和生酮作用。此外,线粒体在其他重要的细胞过程中也有重要作用,包括氨基酸代谢、脂质代谢、血红素生物合成、钙稳态和细胞凋亡等[2]


人类线粒体基因组(mtDNA)长16569bp,包括37个基因,编码了2种rRNA(12S rRNA和16S rRNA)、22种tRNA(同样转运20种标准氨基酸,只是亮氨酸和丝氨酸都有两种对应的tRNA)以及13种多肽(呼吸链复合物Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ的亚基)[3, 4]。mtDNA一般只通过母系遗传,通过卵细胞将mtDNA中的遗传信息传给下一代,使得子代中mtDNA序列和母亲一致。



认识线粒体疾病


线粒体疾病表型复杂,各个表型可单独或重叠出现,主要引起脑病、心脏病、肝病、肾病、视神经病、糖尿病、骨骼肌病、胃肠肌病、周围神经病、听神经病等[3, 5]


线粒体疾病按受累器官可分为线粒体脑病、线粒体脑肌病、线粒体肌病、线粒体糖尿病和线粒体耳聋等。线粒体疾病的异质性非常大,就以MT-ND6 m.14692A>G来说,该变异最早在3个糖尿病和/或耳聋的中国家庭中检出,也有文献在高血压、扩张性心肌病家族中检出[6-8]


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图1  人类线粒体基因组的结构、热点突变及常见临床表型

图源自文末参考文献 [3],后经翻译标注中文




线粒体疾病的诊断流程


一般的诊断流程包括临床表现、生化代谢和影像学检查等,当高度怀疑线粒体病时需进行基因检测。基因检测结果为阴性时,应重新进行临床评估,仍然怀疑线粒体病时,需要进行肌肉或皮肤活检、病理学分析和呼吸链酶学检测,同时进行组织标本遗传学分析。


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图2 线粒体脑肌病诊疗流程

图源《罕见病诊疗指南(2019 年版)》




线粒体基因检测的临床意义


线粒体基因检测可以帮助患者了解线粒体基因突变的风险,患者家庭也可以依据线粒体母系遗传的规律,通过基因检测筛查整个家族,从而采取相应的预防和治疗措施。对已患病但尚未诊断的家系成员,可以早期识别并应用合理的治疗方案,延缓疾病进展;对携带突变基因但尚未患病的家系成员,提前告知定期随诊复查,可用保护线粒体、改善线粒体功能和抗氧化的药物来预防疾病。



适用人群


1)针对疑似线粒体疾病患者,做辅助诊断;

2)具有典型母系遗传特征,临床表现复杂无法确定病症,做鉴别诊断。


ob体育app下载WES检测助力线粒体疾病诊断

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ob体育app下载全外显子组测序产品目前已全面升级,升级后的WES检测产品覆盖了对线粒体全基因组的检测,现在可自由选择线粒体全基因组、线粒体与核基因组联合检测的方案,最大限度从遗传学层次寻找致病原因,为进一步治疗方案的选择提供科学依据,为临床的精准诊断和精准治疗提供帮助。



参考文献


[1] https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/variation/267298/

[2] Fang F. [Diagnosis and treatment of mitochondrial diseases]. Zhonghua Er Ke Za Zhi. 2023;61(4):381-383.

[3] Gorman GS, Chinnery PF, DiMauro S, et al. Mitochondrial diseases. Nat Rev Dis Primers. 2016;2:16080.

[4] Rossmann MP, Dubois SM, Agarwal S, et al. Mitochondrial function in development and disease. Dis Model Mech. 2021;14(6): dmm048912.

[5] McFarland R, Taylor RW, Turnbull DM. A neurological perspective on mitochondrial disease. Lancet Neurol. 2010;9(8):829-40.

[6] Wang M , Liu H , Zheng J ,et al. A Deafness- and Diabetes-associated tRNA Mutation Causes Deficient Pseudouridinylation at Position 55 in tRNAGlu and Mitochondrial Dysfunction. Journal of Biological Chemistry, 2016, 291(40): 21029-21041.

[7] Xu L, Wang M, Li H, et al. Mitochondrial tRNA mutations in 2070 Chinese Han subjects with hypertension. Mitochondrion. 2016 Sep:30:208-21.

[8] Qi Y, Wu Z, Bai Y, et al. Screening for Mitochondrial tRNA Mutations in 318 Patients with Dilated Cardiomyopathy. Hum Hered. 2022 Jan 6.